De basisindeling van Clash of Clans voor Stadhuis 13 is gestructureerd om het verdedigings- en hulpbronnenbeheer te optimaliseren. Op dit niveau kunnen spelers nieuwe verdedigingsstructuren, vallen en legergebouwen bouwen en upgraden. Effectieve ontwerpen zorgen doorgaans voor een evenwicht tussen de toewijzing van middelen, waardoor opslagplaatsen worden beschermd en tegelijkertijd een efficiënte troepeninzet mogelijk wordt gemaakt. Het integreren van sterke defensieve gebouwen zoals Inferno Towers en Scattershots kan het vermogen van een basis om aanvallen van tegenstanders te weerstaan aanzienlijk vergroten.
Naast de indeling van het thuisdorp creëren spelers vaak gespecialiseerde oorlogsbases en trofeebases. Oorlogsbases zijn ontworpen om het aantal sterren dat wordt opgegeven in clanoorlogen te minimaliseren, waarbij de nadruk ligt op het centraliseren van waardevolle gebouwen en het creëren van uitgebreide compartimenten om aanvallers te vertragen. Trofeebases daarentegen proberen aanvallers af te schrikken door het een uitdaging te maken om grondstoffen te plunderen, waardoor trofeeën behouden blijven en de rang in het spel behouden blijft. Elke basisindeling dient een specifiek doel en is afgestemd op de huidige doelen en strategieën van de speler.
Spelers hebben ook online toegang tot een reeks kaarten en lay-outs die inspelen op specifieke ontwerpthema's en verdedigingsstrategieën. Deze kaarten kunnen direct worden gebruikt of worden aangepast aan individuele voorkeuren. Het delen van strategieën en lay-outs binnen de community heeft het voor spelers gemakkelijker gemaakt om hun verdediging te verbeteren en betere resultaten te behalen in gevechten. Voor spelers die vooruitgang willen boeken in Clash of Clans, is het bestuderen van succesvolle basislay-outs en het aanpassen ervan een cruciaal aspect van de gameplay dat tot aanzienlijke voordelen kan leiden in competitieve omgevingen.