Podstawowy układ Clash of Clans dla Town Hall 13 został skonstruowany tak, aby optymalizować obronę i zarządzanie zasobami. Na tym poziomie gracze mogą budować i ulepszać nowe struktury obronne, pułapki i budynki wojskowe. Skuteczne projekty zazwyczaj równoważą alokację zasobów, chroniąc magazyny, jednocześnie umożliwiając efektywne rozmieszczenie żołnierzy. Włączenie silnych budynków obronnych, takich jak Inferno Towers i Scattershots, może znacząco zwiększyć zdolność bazy do przeciwstawienia się atakom przeciwników.
Oprócz układu wioski domowej gracze często tworzą wyspecjalizowane bazy wojenne i bazy trofeów. Bazy wojenne zaprojektowano tak, aby zminimalizować ilość gwiazdek traconych w Wojnach Klanów, skupiając się na centralizacji budynków o wysokiej wartości i tworzeniu skomplikowanych przedziałów, które spowalniają atakujących. Z drugiej strony bazy trofeów starają się odstraszać atakujących, utrudniając plądrowanie zasobów, chroniąc w ten sposób trofea i utrzymując rangę w grze. Każdy układ podstawowy ma inny cel i jest dostosowany do bieżących celów i strategii gracza.
Gracze mają także dostęp do szeregu map i układów online, które odpowiadają konkretnym motywom projektowym i strategiom obronnym. Z map tych można korzystać bezpośrednio lub dostosowywać je do indywidualnych preferencji. Dzielenie się strategiami i układami w ramach społeczności ułatwiło graczom ulepszanie swojej obrony i osiąganie lepszych wyników w bitwach. Dla graczy chcących awansować w Clash of Clans studiowanie udanych układów bazowych i dostosowywanie ich jest krytycznym aspektem rozgrywki, który może prowadzić do znacznych przewag w konkurencyjnych środowiskach.