Trò chơi Clash of Clans cung cấp cho người chơi nhiều cách bố trí căn cứ khác nhau có thể nâng cao lối chơi chiến lược của họ, đặc biệt tập trung vào Tòa thị chính 12. Cấp độ này giới thiệu các lực lượng phòng thủ và quân đội mới, yêu cầu người chơi điều chỉnh thiết kế căn cứ của họ để cải thiện cả khả năng phòng thủ trước các cuộc tấn công và hiệu quả trong quản lý tài nguyên. Người chơi có thể chọn trong số nhiều cách bố trí, bao gồm cấu hình làng quê, căn cứ chiến tranh được thiết kế cho các trận chiến bang hội và căn cứ chiến lợi phẩm nhằm tối đa hóa điểm giải đấu.
Bố cục làng quê có cấu trúc tốt cho Tòa thị chính 12 nhấn mạnh đến việc bảo vệ các công trình quan trọng như kho chứa và chính Tòa thị chính. Người chơi thường phân phối các tòa nhà để tạo ra các ngăn làm chậm kẻ thù, khiến chúng khó tiếp cận các tài sản quan trọng hơn. Ngoài ra, nhiều thiết kế khác nhau cho phép bố trí bẫy và phòng thủ một cách chiến lược, nâng cao hiệu quả tổng thể của căn cứ trước các loại kẻ tấn công khác nhau.
Ngoài việc cá nhân hóa ngôi làng quê hương của mình, người chơi còn tập trung vào việc thiết kế căn cứ chiến tranh và căn cứ chiến tích. Căn cứ chiến tranh được chế tạo đặc biệt để chống lại các cuộc tấn công phối hợp của bang hội trong chiến tranh, ưu tiên phòng thủ hơn là lưu trữ tài nguyên. Mặt khác, các căn cứ cúp được tối ưu hóa để giữ lại các cúp nhằm thăng hạng trong các giải đấu. Các tài nguyên trực tuyến và diễn đàn cộng đồng thường cung cấp cho người chơi các liên kết đến nhiều cách bố trí căn cứ khác nhau, cho phép họ khám phá và áp dụng các chiến lược thành công được những người khác trong trò chơi sử dụng.