Clash of Clans cung cấp cho người chơi cơ hội thiết kế và tùy chỉnh các bố cục cơ sở khác nhau, đặc biệt là cho Tòa thị chính 9. Cấp độ này giới thiệu các tòa nhà và nâng cấp phòng thủ mới đòi hỏi lập kế hoạch chiến lược để đảm bảo chiến thắng trong các trận chiến và bảo vệ tài nguyên. Người chơi có thể tìm thấy các bố cục khác nhau phù hợp cho các mục đích khác nhau như căn cứ của làng quê để bảo vệ tài nguyên của họ khỏi các cuộc tấn công, các cơ sở chiến tranh được tối ưu hóa cho các cuộc chiến gia tộc và các căn cứ chiến lợi phẩm nhằm duy trì hoặc cải thiện số lượng chiến lợi phẩm.
Khi xây dựng một căn cứ làng quê tại Tòa thị chính 9, người chơi phải xem xét vị trí của các kho lưu trữ, tòa nhà phòng thủ và bẫy để tạo ra một vị trí được bao bọc tốt. Bố cục hiệu quả thường liên quan đến các hội trường thị trấn tập trung được bao quanh bởi các cấu trúc phòng thủ, trong khi các kho tài nguyên nên được phân phối để giảm khả năng mất tất cả các tài nguyên trong một cuộc đột kích. Vị trí chiến lược của các bức tường cũng rất quan trọng trong việc làm chậm quân địch và chuyển hướng chúng một cách hiệu quả.
Ngoài làng quê, người chơi có thể truy cập nhiều cách bố trí cho các kịch bản cạnh tranh khác nhau như căn cứ chiến tranh và căn cứ chiến lợi phẩm. Các cơ sở chiến tranh nhằm mục đích giảm thiểu cơ hội của đối thủ đạt được các ngôi sao trong các cuộc chiến gia tộc, trong khi các cơ sở chiến lợi phẩm tập trung vào những kẻ tấn công để duy trì số lượng chiến lợi phẩm cao hơn. Người chơi có thể khám phá các thiết kế cơ sở khác nhau, nghiên cứu hiệu quả của chúng và có khả năng sửa đổi các bố cục hiện có theo phong cách chơi cá nhân và chiến lược gia tộc để đảm bảo họ tối đa hóa thành công của họ trong trò chơi.