Clash of Clans mang đến cho người chơi cơ hội tạo và tùy chỉnh căn cứ của riêng mình, đặc biệt là Tòa thị chính 13, nơi có các tính năng mới và nâng cấp tòa nhà. Bố trí căn cứ đóng một vai trò quan trọng trong cả chiến lược phòng thủ và tấn công, đảm bảo rằng người chơi có thể bảo vệ tài nguyên của mình một cách hiệu quả đồng thời chuẩn bị cho chiến tranh và các trận chiến tranh cúp. Người chơi thường tìm kiếm những thiết kế căn cứ hiệu quả có thể chống chọi lại các cuộc tấn công từ đối thủ, đồng thời hỗ trợ các cuộc chiến tranh bang hội, canh tác và đẩy cúp.
Làng quê hương đóng vai trò là nơi bố trí căn cứ chính mà người chơi làm việc, cho phép họ tổ chức các công trình, phòng thủ và bẫy của mình. Đặc biệt đối với Tòa thị chính 13, các hệ thống phòng thủ mới đã có sẵn, cần được bố trí một cách chiến lược để tối đa hóa hiệu quả của chúng. Người chơi có thể tạo các biến thể của bố cục làng quê để phù hợp với chiến lược chơi cụ thể của mình, cho dù đó là tập trung vào việc giành chiến tích hay chuẩn bị cho các cuộc chiến tranh gia tộc, trong đó việc thiết kế căn cứ chiến tranh được tối ưu hóa là điều cần thiết.
Ngoài việc tùy chỉnh cá nhân, nhiều người chơi còn chia sẻ trực tuyến bản đồ và bố cục xung đột của họ, cung cấp liên kết để tải xuống hoặc sao chép các thiết kế thành công. Việc trao đổi bố cục căn cứ này rất quan trọng trong cộng đồng Clash of Clans, vì người chơi thường tìm kiếm nguồn cảm hứng hoặc các chiến lược đã được chứng minh để nâng cao lối chơi của họ. Với rất nhiều lựa chọn về thiết kế căn cứ—bao gồm căn cứ chiến lợi phẩm, căn cứ chiến tranh và cách bố trí trang trại—người chơi có thể chọn cấu hình phù hợp với mục tiêu và phong cách chơi của mình trong trò chơi chiến lược di động phổ biến này.